Lancet Oncol:肾透明细胞肺癌与肥胖悖论相关的转录组特征分析

2021-10-12 13:08:54 来源:
分享:
一.深入研究剧中

肥胖病患者与膀胱透光蛋白肿瘤 (ccRCC)的不确定性更很低有关,但肥胖病患者又对立地与该病灶的膀胱功能改善有关,其潜在功能尚不确实。现编者对肥胖病患者病患者和经常性身型病患者在原发病灶和腺周腺体里的膀胱脏聚合和自体核糖体四组区别开展深入研究比对。

本文介绍了DNA备注达引起的微环境的区别有助于暗示肥胖病患者病患者的猎食压倒性(肥胖病患者假定)。

二.比对流程三.文章问答1.COMPARZ备注头、TCGA-KIRC备注头、MSK自体疗程备注头数据集收集、矫正

在COMPARZ备注头的453名病患者里,有375名(83%)病患者很强只用的Matrix数据集,疗程前BMI测量以及无进展和总棒状猎食数据集开展比对(备注1)。除119名(26%)过重病患者外,来自COMPARZ试验中的最终备注头以外256名(68%)病患者(n=256)。

备注1.COMPARZ化疗备注头的人口数学方法和诊断相似性

TCGA-KIRC备注头里的332举例病患者里,指标了经膀胱切除练成疗程的152举例(46%)晚期(即AJCC III和IV期)ccRCC病患者的诊断和人口数学方法数据集(备注2)。在除去59名(39%)过重病患者后,最后获得的备注头以外93名病患者(n=93)。

备注2.晚期透光蛋白膀胱蛋白肿瘤TCGA-KIRC备注头的人口学和诊断相似性

从62举例MSK病灶附近腺体备注头里开展膀胱脏切除练成的非前列腺癌透光蛋白RCC病患者里获得了原发性病灶和病灶附近脂肪组织样品。在这个备注头里,从59名病患者的PNN(膀胱周附近)病灶附近脂肪组织,25名病患者的PNA(远处膀胱周)病灶附近脂肪组织以及55名病患者的病灶该四组织里时域。在除去过重病患者之后,最终备注头以外41名(69%)PNN抽样病患者, PNA抽样为17(68%),病灶抽样为37(67%)。从最初的203名自发性的MSK自体疗程深入研究年轻人里除去74名(36%)过重病患者后,总猎食比对的最终备注头以外129名(64%)自发性(备注3)(n=129)。

备注3. 采用MSK自体疗程的化疗备注头的人口数学方法和诊断相似性

2.肥胖病患者的膀胱透光蛋白肿瘤病患者相对于经常性身型的膀胱透光蛋白肿瘤病患者总猎食期更慢

根据KM猎食比对,在一四组里都见到肥胖病患者病患者的总猎食期更慢。在TCGA-KIRC备注头里,经分阶段解析后,肥胖病患者病患者的总棒状存活期见长经常性身型四组;在COMPARZ备注头里,经IMDC不确定性评级解析后,胖病患者的总棒状存活期也见长经常性身型四组。在MSK自体疗法备注头里,经IMDC不确定性评级解析后,BMI与比率的无显着区别(如上图1)。

上图1.TCGA-KIRC备注头 (A)、COMPARZ 备注头(B)和MSK自体疗程备注头(C)的总猎食期

3.COMPARZ备注头里肥胖病患者病患者很强更很低的PFS

对CPMPARZ备注头KM比对后,KM曲率辨识,COMPARZ备注头里肥胖病患者病患者比经常性身型病患者很强更很低的PFS。

上图S1.COMPARZ备注头里肥胖病患者病患者比经常性身型病患者很强更很低的PFS

4.运用于二线药品疗程,肥胖病患者病患者仍很强更很低的OS

KM曲率辨识了在运用于二线乙酰丝氨酸药品(pazopanib或Sunitinib)的两个疗程四组里,肥胖病患者病患者的OS始终较经常性身型病患者好。

上图S2.COMPARZ备注头运用于二线药品疗程四组的总猎食期比对

5.COMPARZ备注头里,肥胖病患者与经常性身型的病患者核糖体四组DNA相似性存在显着区别

刚才上述比对,编者在三个备注头里确认肥胖病患者假定存在之后,几周在COMPARZ备注头里对肥胖病患者和经常性身型病患者指标了病灶核糖体四组学区别。先是做了HallmarkDNA集的GSEA比对,较为肥胖病患者病患者与经常性身型病患者彼此两者之间的区别:肥胖病患者病患者里辨识肺部、TGF-β、结缔组织-两者之间充质转变和膀胱脏聚合信号通路显着调升,提示血块钙化除此以外的激活(上图A)。上图B是对上图A筛选的几个DNA备注达通路的Enrichment plots。

上图S4.COMPARZ备注头里肥胖病患者病患者与经常性身型病患者的ccRCC病灶核糖体四组DNA相似性存在显着区别

6.COMPARZ备注头与TCGA-KIRC备注头 里肥胖病患者比经常性身型病患者的膀胱脏聚合评级很低

在GESA共通的相似性DNA集膀胱脏聚合评级较为里,肥胖病患者病患者很低于经常性身型病患者(如上图2)。

上图2.COMPARZ备注头(A)与TCGA-KIRC备注头 (B)里肥胖病患者原发病灶病患者与经常性身型病患者的膀胱脏聚合的z score

7.经常性身型与肥胖病患者病患者病灶的诱导群无显着区别

对经常性身型(7举例)与肥胖病患者(16举例)病患者的原发病灶的主要诱导数量外采用流式蛋白练成开展指标。上图A辨识了肥胖病患者病患者与经常性病患者彼此两者之间的诱导群的总棒状区别。上图B确实辨识了肥胖病患者和经常性身型病患者T蛋白群的常为准确度。见到经常性身型与肥胖病患者病患者病灶的诱导群无轻微区别,诱导常为的程度与BMI无关。

上图S9.用流式蛋白练成比对经常性身型与肥胖病患者病患者病灶的诱导群无轻微区别

8.与经常性身型病患者相比,肥胖病患者病患者腺周腺体炎病患者更很低,尤其是病灶附近的腺周脂肪组织

在MSK的非前列腺癌ccRCC病患者的前瞻性备注头里,编者改四组了20个最显着的充沛的IPA标准通路,这些通路来自于肥胖病患者和经常性身型病患者的PNN和PNA抽样的较为(上图A)。肥胖病患者和经常性身型病患者的PNN和PNA抽样彼此两者之间的自体常为(ssGSEA评级)较为(上图B)。

上图S5.与经常性身型的病患者相比,肥胖病患者病患者的膀胱周脂肪组织辨识出炎病患者和肺部更很低

综上,在COMPARZ试验中备注头里,经过IMDC不确定性评级调整后,见到相对于经常性身型病患者,乙酰丝氨酸药品疗程更很低了肥胖病患者病患者的猎食率,值得注意是接受sunitinib疗程的病患者。IMDC不确定性评级三维还以外的反应物两者之间接反映宿主原因对乳肿瘤系统性炎病患者效用(举例如贫血,相似性性白血球剧增,和血栓剧增病患者),这些原因确实也是自体疗程结果和BMI彼此两者之间关联功能的原因。见到肥胖病患者病患者的病灶膀胱脏聚合分数很低于经常性身型病患者,与之前其他的深入研究结果备注明的,参与膀胱脏聚合,β-氧化除此以外等等DNA的富集的物理现象一致。因此,膀胱脏聚合的区别可以部份暗示肥胖病患者病患者接受乙酰丝氨酸药品疗程后的较好膀胱功能。

此深入研究为肥胖病患者假定备有了生物学支持。在身患ccRCC的病患者观察到肥胖病患者病患者相对于经常性身型的病患者病灶微环境的区别:值得注意是肥胖病患者病患者的病灶的膀胱脏聚合更很低,但总棒状炎病患者无轻微区别。值得注意的是肥胖病患者病患者的病灶附近脂肪组织辨识更很低的炎病患者和肺部状况。透光蛋白肿瘤与腺周腺体微环境的多样相互效用确实很强诊断意义,值得进一步深入研究。

原始出处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

分享:

相关问答

推荐阅读

重庆整形医院/a> 济南整形医院 广州整形医院 宁波整形医院 深圳整形医院