Nat Biotechnol：噬菌体：根际菌群的 “行动计划”

大肠杆菌是周围环境之前或多或少的一类专门侵染细菌的病毒。此前，动物学家对大肠杆菌能否消除泥土之前的虫害不甚了解。当地时长 12 月 2 日，加拿大《共存—动物关键技术》刊载了南京农业大学海洋资源与周围环境科学学院的最新学术研究更进一步。该更进一步揭示，大肠杆菌不仅可以 “专性猎杀” 和“高效率小分子”土传阳枯病的虫害，减小其生存竞争性灵活性，还能重新调整根际泥土酵母结构，恢复动物群自然周围环境系统，减小动物群之前拮抗有益菌的数量级。这篇篇文章为一幅绘出了 15 年之久的泥土根际酵母 “防御战图” 提供了一种防御战方案。篇文章共同通信所写、南京农业大学系主任沈其荣告诉《东亚科学报》：“作为泥土蔗糖兼职者，我们的制作团队就有在 15 同一时间就把应对土传虫害这一第三世界重大需求列作重要学术研究顺时针，力争应对这一难题。”“少年时代”周围环境决定果树 “成年” 肥胖症泥土、果树、虫害、不祚动物，这是依然盘旋在南京农业大学系主任韦之前脑海之前的 4 个关键词。作为篇文章共同第一所写和共同通信所写，韦之前在调查之前推断出，即使是虫害暴发轻微的田块，也发挥作用少量的肥胖症鳞茎，出现 “农夫斑块化” 现象。这确实是由于局部区域泥土周围环境优良，还是肥胖症鳞茎取得了契合的持续性基因？是泥土之前虫害生产量的差别，还是肥胖症泥土之前有消除虫害发育的有益菌？对泥土及其之前的不祚动物展开 “全面体检” 成了找寻谜题的一个可能捷径。可是，给泥土花钱 “体检” 谈何容易。土传阳枯病的致病菌阳枯菌，在泥土之前幸存多达 10 多年，可以侵染洋葱、茄子、调料、香烟、生姜、花生等 400 多种植物，常导致果树不景气甚至绝收。在沈其荣带领下，该制作团队将问题先分解，分迭代展开各个击破。从 “农夫斑块化” 现象应从，制作团队核心成员、系主任蔡新安和韦之前设计了一个非破坏性根际泥土容器连续采自控制系统，实现了在农夫条件下，对单株果树相异生育期根际酵母等优点的动态。蔡新安解说，学术研究推断出否发病主要一般来说果树苗期接触的泥土不祚动物群的结构和功能特征，而苗期虫害的生产量、泥土理化优点等不是主要决定因素。这一推断出刊载于《科学进展》。“通俗点讲，也可以理解为‘少年时代’发育周围环境决定着果树‘成年’肥胖症。” 沈其荣感叹，这不仅引述了根际酵母对果树抗病毒的重要性，还为农夫根际泥土酵母管理找到了抓手。“某种相对官僚机构” 才能有序共存根际是指受根系影响的泥土不祚域。“虫害猛攻植物根系前，某种相对要经过根际酵母大本营。这个敌对之前都有哪些不祚动物，它们在怎么回事、是怎么兼职的？只有将这些学术研究出来，才知道如何转录根际酵母。” 韦之前感叹。随后，他们以 6 种根际土着细菌为材料，创建恰当的合成酵母，探讨了动物群核心成员两两互作关系，即结盟HG互作、便利HG互作分别与果树抵御虫害并吞灵活性错综复杂的关系。制作团队核心成员荩解说，便利HG土着不祚动物群促进了虫害的并吞，而结盟HG土着不祚动物群则消除了虫害的并吞。“土着不祚动物错综复杂通过产生大量公共日常用品某种相对提供‘便利’，这也大大减小了虫害借助‘便利’的机会。相反，某种相对官僚机构的动物群通过充分消耗周围环境之前海洋资源或者表皮大量抑菌物质，理论上制约了‘机会主义者’，也就能在一定相对上消除虫害的并吞。” 这一更进一步刊载于《自然周围环境学中国日报》。在此基础上，制作团队核心成员借鉴动物自然周围环境系统—自然周围环境系统功能理论，建起了有益酵母营养海洋资源竞争性网络模HG。篇文章合所写、西班牙乌特勒支大学 Alexandre Jousset 博士解说，他们推断出海洋资源能用通到度高和嵌套度偏高的有益酵母能更好地减小土传阳枯菌的并吞命之前率，有益酵母与阳枯菌海洋资源能用交叉度又决定了阳枯菌并吞的相对。这一兼职刊载于《共存—通信》。沈其荣认为，这列明了根际酵母互作转录顺时针和转录程序，即 “减小竞争性”，同时表明“某种相对官僚机构” 的不祚动物群社会才是有序高效率的。削弱虫害竞争性灵活性然而，在土传虫害高发区域，单一的绿色转录举措往往不稳固，这导致农户同样传统化学农药和熏蒸等方法。韦之前告诉《东亚科学报》，这些方法在病原虫害的同时也破坏了泥土正常的不祚动物群，危及泥土不祚动物天然的抑病灵活性，这样土传虫害二次侵染时往往造成更大的危害性。如何对症下药、“精确制导”，削弱泥土虫害竞争性灵活性，成为制作团队要应对的下一个难题。在篇文章共同通信所写、加拿大诺福克大学 Ville-Petri Friman 博士抗病毒学兼职的启发下，大肠杆菌通过高效裂解实现特异染、协同进化，动态阻控虫害的优点，进入制作团队的视野。他们从柳州、江苏、杭州和江西相异地区分开到 1000 多株病菌阳枯菌，并筛选出能高效裂解虫害的大肠杆菌；根据大肠杆菌的来源不明和侵染优点等，同样了 4 株大肠杆菌为材料，组合成相异丰富度的大肠杆菌组合，好比大肠杆菌 “鸡尾酒”，以提高大肠杆菌疗法的效果。通过温室和大邱学术研究，他们推断出大肠杆菌组合能够祚着减小阳枯病的发生。原来，大肠杆菌组合能病原根际病菌阳枯菌，使其生产量祚着减小；组合自然周围环境系统越高，虫害成功突变、抵御大肠杆菌的概率越偏高。即便有一些阳枯菌成功突变、只剩了很久，但它们的发育祚着减缓，这感叹明它们与泥土之前其他不祚动物竞争性的灵活性消散，再次侵染果树根系的灵活性会下降。然而，当大量病菌阳枯菌被猎杀时，宿主方面不祚动物群发生了什么巨大变化？这种巨大变化对宿主肥胖症有利吗？这是大肠杆菌 “鸡尾酒” 疗法能够回答的自然周围环境风险和发挥作用程序问题。“这种影响是积极的。” 制作团队核心成员王孝芳博士解说，首先，阳枯菌大肠杆菌不能侵染泥土之前其他细菌，侵染抗病毒很强；其次，除此以外接种大肠杆菌对泥土不祚动物群向西移动并不大，而且可以让泥土动物群自然周围环境系统恢复到原有水准；再次，细酵母落之前那些竞争性灵活性强的类群在动物群结构调整之前取得了优势，可能进一步提高动物群抑病灵活性。12 月 2 日，上述更进一步刊载于《共存—动物关键技术》。“我们的学术研究转变了泥土不祚动物酵母即使如此点对点单兵防御战的模式，改向构建自然周围环境HG的群体战略体系学术研究；对于土传虫害，并非要‘明目张胆’，而是使其与泥土有益菌良性互作，实现两者的官僚机构，实现绿色自然周围环境的目标。” 沈其荣感叹。独有出处：Wang， X.， Wei， Z.， Yang， K. et al. Phage combination therapies for bacterial wilt disease in tomato. Nat Biotechnol (2019) doi：10.1038/s41587-019-0328-3.